Altunkaya hakkında yapılan şikayette, eserlerinin gerçekte yayımlanmadığı, intihal içerdiği ve idareyi kandırmak amacıyla sahte belgelerle profesörlük kadrosuna atandığı belirtildi. İncelemede, Altunkaya’nın “Fitness Sözleşmesi” adlı kitabının, Hans Geisler’in Almanca eserinden neredeyse tamamen çeviri olduğu ve bu durumu gizlemek için çok az ekleme yapıldığı tespit edildi.
Kitapta çeviri programı izlerine de rastlandı. Örneğin, bir sayfada kalan dipnot numarası ve hatalı terim çevirileri dikkat çekti. Soruşturma sonucunda, Altunkaya'nın profesörlük başvurusunda kullandığı makalelerden birinin hiç yayımlanmadığı, diğerinin ise başvuru şartlarını karşılamadığı belirlendi.
Altunkaya savunmasında, Almanca kaynaklardan yoğun yararlandığını, çeviri yaptığını ancak etik ihlal kastı olmadığını öne sürdü. Ancak bilirkişi raporu ve üniversite kurulları aksini belirledi. Bu çerçevede, 2015’teki profesörlük kadrosu geçersiz sayıldı ve doçentlik kadrosuna düşürüldü.
Altunkaya, profesörlük unvanı ile yaklaşık 10 yıldır rektör yardımcılığı, dekanlık ve kurul üyeliği gibi görevlerde bulundu. Üniversite, şimdiye kadar aldığı ek maaşlar, memuriyetten çıkarılıp çıkarılmayacağı ve olası suç duyurusuna ilişkin açıklama yapmadı.